More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2295 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  100 
 
 
475 aa  943    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  42.61 
 
 
464 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  40.04 
 
 
463 aa  349  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  30.95 
 
 
475 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  33.56 
 
 
445 aa  220  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  30.92 
 
 
470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
461 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  31.06 
 
 
463 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  30.16 
 
 
467 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  29.89 
 
 
464 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  29.82 
 
 
461 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  30.84 
 
 
464 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  30.2 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  30.2 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  30.2 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  30.2 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  30.2 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  30.2 
 
 
464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  30.36 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  29.98 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  31.71 
 
 
500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  29.6 
 
 
463 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  30.11 
 
 
485 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  29.22 
 
 
475 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.86 
 
 
460 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  28.45 
 
 
475 aa  183  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.26 
 
 
500 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.16 
 
 
499 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.88 
 
 
518 aa  179  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  30 
 
 
481 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  26.25 
 
 
468 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29.59 
 
 
468 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.59 
 
 
525 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
450 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  26.27 
 
 
468 aa  170  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.86 
 
 
486 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
554 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.78 
 
 
464 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.96 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  29.12 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.55 
 
 
462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.89 
 
 
538 aa  166  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.03 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  26.8 
 
 
450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  30.63 
 
 
473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.66 
 
 
469 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.29 
 
 
477 aa  162  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
448 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
459 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.54 
 
 
453 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
455 aa  156  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.09 
 
 
470 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
456 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.37 
 
 
452 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.85 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.13 
 
 
500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.62 
 
 
462 aa  153  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
448 aa  152  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
450 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  28.34 
 
 
454 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.04 
 
 
454 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
446 aa  147  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26 
 
 
485 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.5 
 
 
446 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
467 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
484 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
464 aa  144  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.32 
 
 
438 aa  143  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.56 
 
 
460 aa  143  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
453 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
458 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
462 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.53 
 
 
451 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.77 
 
 
483 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  26.16 
 
 
486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
443 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  24.57 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.22 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  29.51 
 
 
462 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
469 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  26.8 
 
 
478 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
463 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25 
 
 
453 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  26.2 
 
 
547 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.2 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.2 
 
 
484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  26.2 
 
 
547 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.85 
 
 
463 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.2 
 
 
546 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>