More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2333 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  100 
 
 		 456 aa  894    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  39.29 
 
 		 481 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2651  MATE efflux family protein  34.47 
 
 		 495 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0999  MATE efflux family protein  38.91 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0693  MATE efflux family protein  38.15 
 
 		 489 aa  220  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2521  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28 
 
 		 475 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1596  MATE efflux family protein  32.08 
 
 		 438 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000302768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.77 
 
 		 461 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 467 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 481 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0048  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.331446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 452 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 469 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 500 aa  113  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 464 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.39 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 464 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.43 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  23.2 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.43 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.4 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 460 aa  107  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  22.97 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  21.99 
 
 		 446 aa  106  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  26.17 
 
 		 547 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  26.17 
 
 		 547 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.17 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.17 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.17 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  26.18 
 
 		 495 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  27.81 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 554 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 459 aa  99.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.53 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 473 aa  96.7  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 475 aa  96.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.29 
 
 		 462 aa  94.4  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 447 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  23.91 
 
 		 502 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>