More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2237 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  100 
 
 
469 aa  908    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  50.8 
 
 
462 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  48.53 
 
 
468 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  47.76 
 
 
483 aa  362  9e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  33.09 
 
 
458 aa  253  7e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  35.42 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  33.65 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  31.88 
 
 
464 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  31.9 
 
 
469 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  31.72 
 
 
464 aa  217  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  32.37 
 
 
461 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  29.88 
 
 
453 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  33.97 
 
 
452 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  30.14 
 
 
438 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  35.25 
 
 
447 aa  193  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  35.01 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.84 
 
 
445 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  32.88 
 
 
486 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  32.99 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  30.93 
 
 
498 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.99 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  34.72 
 
 
452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  34.03 
 
 
452 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  31.36 
 
 
470 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  30.94 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  29.66 
 
 
475 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
464 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.04 
 
 
460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  32.44 
 
 
485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  33.49 
 
 
453 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29.21 
 
 
462 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  30.23 
 
 
461 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  30.54 
 
 
518 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.95 
 
 
500 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  30.22 
 
 
499 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  30.4 
 
 
446 aa  163  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.87 
 
 
454 aa  162  1e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  29.75 
 
 
461 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  28.09 
 
 
472 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  29.83 
 
 
546 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  32.91 
 
 
470 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  31.1 
 
 
474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  29.83 
 
 
546 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  29.83 
 
 
495 aa  156  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  29.83 
 
 
547 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  29.83 
 
 
547 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25.85 
 
 
463 aa  156  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  28.85 
 
 
446 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.56 
 
 
455 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
464 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  29.83 
 
 
484 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.73 
 
 
448 aa  155  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  29.15 
 
 
476 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  29.15 
 
 
474 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  29.59 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
467 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
464 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  28.92 
 
 
474 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  31.26 
 
 
484 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
475 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  29.52 
 
 
495 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  30.19 
 
 
502 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  26.54 
 
 
464 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  26.54 
 
 
464 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.62 
 
 
463 aa  151  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.29 
 
 
468 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  26.54 
 
 
464 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  26.54 
 
 
464 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  26.54 
 
 
464 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  26.54 
 
 
464 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  30.2 
 
 
476 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.78 
 
 
463 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  31.03 
 
 
480 aa  149  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  26.54 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  26.73 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  26.02 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  30.42 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.07 
 
 
475 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.14 
 
 
490 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
456 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.25 
 
 
500 aa  147  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  29.59 
 
 
478 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  22.37 
 
 
469 aa  143  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
450 aa  143  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.49 
 
 
538 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
481 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.49 
 
 
469 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.54 
 
 
458 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.86 
 
 
469 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.86 
 
 
469 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.77 
 
 
554 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  27.27 
 
 
446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
467 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
469 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
448 aa  137  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.98 
 
 
496 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  28.92 
 
 
461 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.35 
 
 
458 aa  136  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>