More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1359 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 408 aa  796    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  44.15 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  35.05 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  32.58 
 
 		 444 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  32.18 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  34.71 
 
 		 446 aa  189  8e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  29.43 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 469 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  30.35 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  33.89 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  33.61 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  31.11 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  32.84 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  33.43 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  31.17 
 
 		 483 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  28.03 
 
 		 463 aa  126  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 485 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  27.17 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 500 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  26.9 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 554 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  27.17 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  29.36 
 
 		 456 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  22.8 
 
 		 472 aa  116  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25 
 
 		 538 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  27.17 
 
 		 452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  28.18 
 
 		 454 aa  114  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  26.9 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  26.9 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  26.9 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  26.9 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  24.46 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 499 aa  113  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 500 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 448 aa  113  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  26.9 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  30.69 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 466 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  26.56 
 
 		 457 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.65 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 475 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  26.36 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  22.19 
 
 		 518 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 525 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25.93 
 
 		 428 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 498 aa  103  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 448 aa  102  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  26.63 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  26.69 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 459 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 457 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 467 aa  99.8  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  22.72 
 
 		 498 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 462 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 425 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1888  MATE efflux family protein  28.53 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  22.42 
 
 		 469 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  26.57 
 
 		 460 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 469 aa  96.7  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  27.35 
 
 		 480 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  21.35 
 
 		 500 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>