More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3317 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  100 
 
 		 469 aa  903    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  50.34 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  52.44 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0048  MATE efflux family protein  46.98 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3694  MATE efflux family protein  48.64 
 
 		 472 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0048  MATE efflux family protein  46.9 
 
 		 460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5998  MATE efflux family protein  45.71 
 
 		 486 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.926416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4118  MATE efflux family protein  47.98 
 
 		 468 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3795  MATE efflux family protein  47.22 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  39.16 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3623  MATE efflux family protein  36.3 
 
 		 457 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1888  MATE efflux family protein  39.02 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0796  multi anti extrusion protein MatE  35.8 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1675  MATE efflux family protein  37.59 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5248  multi antimicrobial extrusion protein MatE  37.41 
 
 		 478 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0908  multi anti extrusion protein MatE  36.52 
 
 		 483 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0522974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0771  putative cation-driven multidrug efflux pump  36.47 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.97 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3218  multi anti extrusion protein MatE  35.2 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3060  multi anti extrusion protein MatE  36.12 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  28.87 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 484 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 500 aa  126  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 454 aa  124  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 452 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  28.75 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 461 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 525 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 462 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 470 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.42 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  30 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  25 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 453 aa  107  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  29.92 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 486 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.07 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.49 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.41 
 
 		 478 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  31.68 
 
 		 460 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 490 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 454 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.46 
 
 		 454 aa  100  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 475 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 554 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.65 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  29.77 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 460 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 469 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 469 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 475 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  30.42 
 
 		 472 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.49 
 
 		 496 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  28.68 
 
 		 521 aa  94  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  23.32 
 
 		 469 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  23.32 
 
 		 469 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  23.32 
 
 		 469 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>