More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6399 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  100 
 
 		 425 aa  825    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  44.63 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  41.84 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 475 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.63 
 
 		 461 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 452 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 461 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 470 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 486 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 446 aa  119  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  24.63 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 469 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25 
 
 		 475 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 498 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  29.27 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 459 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 471 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  25.48 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 485 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  24.71 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 447 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6233  MATE efflux family protein  25 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 467 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 451 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  28.86 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 447 aa  97.8  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 525 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 481 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 468 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 464 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 538 aa  96.7  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 460 aa  96.3  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  23.75 
 
 		 463 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  26.95 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  26.18 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.43 
 
 		 502 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.52 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 458 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 458 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 456 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.52 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 464 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  25.39 
 
 		 466 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25.81 
 
 		 474 aa  93.2  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 445 aa  93.2  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 457 aa  92.8  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 464 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 554 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  21.9 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  23.83 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  22.33 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  25.06 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  23.83 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  24.64 
 
 		 454 aa  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23 
 
 		 475 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.3 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.3 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  27 
 
 		 460 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.3 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.3 
 
 		 469 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.3 
 
 		 469 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>