More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2514 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  99.57 
 
 		 463 aa  919    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  100 
 
 		 463 aa  921    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  37.05 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  39.78 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  34.89 
 
 		 479 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  35.35 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  35.19 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  32.59 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  32.59 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  36.22 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  35.15 
 
 		 445 aa  272  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  31.83 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  30.11 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  32.06 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  30.11 
 
 		 458 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  30.72 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  29.65 
 
 		 461 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  29.53 
 
 		 458 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 449 aa  211  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  30.31 
 
 		 460 aa  209  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 484 aa  206  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  28.26 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  27.8 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  24.94 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  22.62 
 
 		 464 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  22.44 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  22.44 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  22.44 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  22.96 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  22.44 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  22.44 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  22.44 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  22.44 
 
 		 464 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  21.67 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.65 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.65 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.65 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.65 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.65 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 464 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 446 aa  113  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.35 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.82 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.39 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  21 
 
 		 463 aa  107  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  21.87 
 
 		 469 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 461 aa  103  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 442 aa  103  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0687  DNA damage inducible protein - mate transporter family  22.76 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.71 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 500 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  23.98 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 451 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  22.99 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  23.19 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 500 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  25 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 469 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 451 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.93 
 
 		 462 aa  97.4  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 460 aa  97.1  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 554 aa  97.1  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  26 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  24.06 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  21.49 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 466 aa  94.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  21.05 
 
 		 464 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>