More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0686 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  72.92 
 
 
486 aa  663    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  100 
 
 
498 aa  946    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  35.71 
 
 
504 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  35.83 
 
 
500 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  35.44 
 
 
498 aa  229  9e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3461  MATE efflux family protein  35.52 
 
 
475 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  34.98 
 
 
481 aa  226  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  35.65 
 
 
502 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  34.39 
 
 
481 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1498  MATE efflux family protein  35.16 
 
 
478 aa  220  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
475 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  29.01 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  29.28 
 
 
467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.91 
 
 
500 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
438 aa  150  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1362  MATE efflux family protein  31.6 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.89 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  29.82 
 
 
459 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  30.36 
 
 
473 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.72 
 
 
445 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
464 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.89 
 
 
458 aa  136  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.82 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.45 
 
 
453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.26 
 
 
485 aa  128  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  28.9 
 
 
498 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
468 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
467 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  30.19 
 
 
470 aa  124  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  31.61 
 
 
490 aa  123  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.61 
 
 
469 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.75 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  29.17 
 
 
518 aa  120  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.49 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.69 
 
 
462 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.32 
 
 
499 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  28.93 
 
 
464 aa  117  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.93 
 
 
483 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.89 
 
 
464 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.37 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.31 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.54 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.65 
 
 
468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  26.26 
 
 
484 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  28.36 
 
 
470 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
469 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.3 
 
 
554 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
452 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
485 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.67 
 
 
462 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  28.92 
 
 
483 aa  106  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
460 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.89 
 
 
467 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.74 
 
 
475 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.75 
 
 
538 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.08 
 
 
468 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  29 
 
 
461 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  29.63 
 
 
474 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  25.65 
 
 
408 aa  103  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  29.02 
 
 
470 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.12 
 
 
470 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.17 
 
 
448 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.68 
 
 
459 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  24.03 
 
 
463 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  24.03 
 
 
463 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  24.81 
 
 
477 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.4 
 
 
496 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  28.17 
 
 
425 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
453 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  24.23 
 
 
463 aa  97.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  29.17 
 
 
469 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
455 aa  97.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  21.27 
 
 
460 aa  97.1  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.24 
 
 
452 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.11 
 
 
454 aa  96.3  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.47 
 
 
475 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
455 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
455 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2100  MATE efflux family protein  30.83 
 
 
491 aa  95.5  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.114433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
455 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  24.18 
 
 
445 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
464 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.87 
 
 
428 aa  95.1  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.25 
 
 
453 aa  94.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.22 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.93 
 
 
446 aa  94  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  24.78 
 
 
464 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.49 
 
 
463 aa  94  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.06 
 
 
455 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25 
 
 
464 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  28.04 
 
 
503 aa  93.6  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  24.2 
 
 
458 aa  93.6  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>