More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28350 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  100 
 
 
428 aa  850    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  44.63 
 
 
425 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  36.53 
 
 
442 aa  255  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.24 
 
 
461 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.48 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
475 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.6 
 
 
459 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  21.39 
 
 
438 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.97 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  29.18 
 
 
486 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  23.43 
 
 
452 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.31 
 
 
464 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.31 
 
 
464 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  22.51 
 
 
461 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.36 
 
 
470 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  23.02 
 
 
453 aa  96.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  24.34 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  24.06 
 
 
463 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  24.06 
 
 
463 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25 
 
 
458 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  23.01 
 
 
453 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  24.09 
 
 
466 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
458 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
458 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  24.1 
 
 
468 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
470 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  22.65 
 
 
467 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  23.87 
 
 
460 aa  92  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  28.72 
 
 
498 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.73 
 
 
469 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.57 
 
 
446 aa  90.1  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.5 
 
 
458 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  21.43 
 
 
464 aa  89.7  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  23.76 
 
 
425 aa  89  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  22.74 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.37 
 
 
475 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  24.07 
 
 
461 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.64 
 
 
469 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
450 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
450 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  22.6 
 
 
445 aa  87  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  22.97 
 
 
408 aa  86.7  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  21.41 
 
 
454 aa  86.7  7e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  26.67 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  25.2 
 
 
459 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  26.83 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  24.43 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  25.35 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  24.43 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  22.46 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.76 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  23.64 
 
 
454 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.32 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  24.05 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  22.54 
 
 
460 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  21.96 
 
 
442 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  20.51 
 
 
455 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  24.65 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  24.37 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  23.34 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  23.65 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  21.58 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  23.37 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  22.43 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  21.91 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  21.63 
 
 
468 aa  79.7  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  22.73 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  24.23 
 
 
447 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  23.75 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  26.21 
 
 
476 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  23.45 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  21.86 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  23.01 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  26.84 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  25.6 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  25.06 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  24.23 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  23.94 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1371  multidrug resistance protein NorM, putative  26.67 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2383  multidrug resistance protein  26.67 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2255  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1133  putative multidrug resistance protein NorM  26.67 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1862  putative multidrug resistance protein NorM  26.67 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0035  putative multidrug resistance protein NorM  26.67 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0708926  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2217  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  24.08 
 
 
500 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  23.99 
 
 
448 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  20.82 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  24.13 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  24.85 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2211  multidrug resistance protein NorM, putative  26.81 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0676191  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.82 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  23.04 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.46 
 
 
484 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  21.75 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>