More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4468 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  71.6 
 
 		 500 aa  708    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  79.83 
 
 		 481 aa  772    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  100 
 
 		 481 aa  932    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  62.28 
 
 		 504 aa  580  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  58.79 
 
 		 498 aa  525  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  49.79 
 
 		 502 aa  458  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3461  MATE efflux family protein  43.4 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1498  MATE efflux family protein  42.83 
 
 		 478 aa  295  9e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  34.39 
 
 		 498 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  34.11 
 
 		 486 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 469 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 467 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 475 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 473 aa  117  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 438 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 554 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 445 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1362  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 437 aa  97.8  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 449 aa  97.4  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 490 aa  95.9  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 518 aa  94.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 485 aa  93.6  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 462 aa  93.6  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 525 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 458 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.27 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 484 aa  90.9  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 454 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  24.06 
 
 		 496 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 498 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  25.78 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 453 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 453 aa  87  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.64 
 
 		 462 aa  86.7  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 463 aa  87  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.05 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  23.34 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.95 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.95 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.05 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.95 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.83 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 474 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  23.33 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  23.72 
 
 		 546 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  26.34 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.74 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0048  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.331446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  24.83 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.12 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.12 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.64 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>