More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1498 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1498  MATE efflux family protein  100 
 
 
478 aa  911    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3461  MATE efflux family protein  76.99 
 
 
475 aa  673    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  42.92 
 
 
481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  43.64 
 
 
502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  42.54 
 
 
504 aa  318  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  43.67 
 
 
481 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  41.14 
 
 
500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  40.97 
 
 
498 aa  299  8e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  35.71 
 
 
498 aa  243  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  35.17 
 
 
486 aa  219  7e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
469 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.89 
 
 
475 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  29.82 
 
 
473 aa  114  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.43 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1362  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
437 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
498 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.12 
 
 
438 aa  109  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.35 
 
 
486 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.58 
 
 
475 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  24.4 
 
 
446 aa  103  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
499 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.76 
 
 
467 aa  100  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
490 aa  99.8  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.46 
 
 
455 aa  99  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.22 
 
 
481 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  27.72 
 
 
466 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.36 
 
 
500 aa  96.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.11 
 
 
464 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
518 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  29.11 
 
 
459 aa  95.1  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.05 
 
 
470 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.45 
 
 
500 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.37 
 
 
463 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
538 aa  93.2  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.1 
 
 
470 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  21.51 
 
 
450 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
468 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.45 
 
 
485 aa  90.9  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  31.01 
 
 
468 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.55 
 
 
461 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.52 
 
 
500 aa  90.1  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.51 
 
 
485 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.75 
 
 
462 aa  89.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25 
 
 
458 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  21.13 
 
 
408 aa  88.2  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.5 
 
 
454 aa  87.4  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
441 aa  86.7  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  25.82 
 
 
469 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.23 
 
 
446 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  24.04 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
525 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
554 aa  83.2  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  22.78 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
454 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.29 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.99 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.22 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.67 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.2 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.55 
 
 
483 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  26.42 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
472 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  22 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  23.64 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  28.07 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  24.76 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.33 
 
 
464 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  23.9 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  21.82 
 
 
455 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.33 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  23.5 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  20.42 
 
 
462 aa  77  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
461 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  24.51 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.38 
 
 
469 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  23.39 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.38 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  20.7 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.4 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.73 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.04 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  23.16 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  23.26 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  24.95 
 
 
484 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.57 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.83 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.13 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
450 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  23.3 
 
 
438 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  21.96 
 
 
445 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  23.89 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.05 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>