More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1672 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  100 
 
 
498 aa  970    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  59.41 
 
 
481 aa  548  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  59.2 
 
 
504 aa  530  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  54.42 
 
 
500 aa  520  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  58.79 
 
 
481 aa  520  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  50.1 
 
 
502 aa  448  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3461  MATE efflux family protein  41.68 
 
 
475 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1498  MATE efflux family protein  40.97 
 
 
478 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  36.5 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  35.44 
 
 
498 aa  232  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.47 
 
 
475 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
438 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.28 
 
 
469 aa  124  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  29.5 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  23.95 
 
 
450 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.77 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.91 
 
 
525 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.49 
 
 
461 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.33 
 
 
467 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
485 aa  106  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.36 
 
 
458 aa  104  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
467 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26 
 
 
495 aa  104  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26 
 
 
484 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.41 
 
 
484 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  26 
 
 
547 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  26 
 
 
547 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.41 
 
 
495 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  25.88 
 
 
546 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  25.41 
 
 
546 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  23.43 
 
 
453 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  24.44 
 
 
460 aa  99.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  23.08 
 
 
446 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.32 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
463 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
463 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  24.4 
 
 
446 aa  99  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1362  MATE efflux family protein  28.87 
 
 
437 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  23.33 
 
 
458 aa  98.6  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  23.43 
 
 
458 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.59 
 
 
450 aa  97.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  24.24 
 
 
490 aa  97.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.77 
 
 
445 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
453 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.45 
 
 
483 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.82 
 
 
463 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  22.27 
 
 
453 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.83 
 
 
485 aa  93.2  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
453 aa  91.7  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.98 
 
 
486 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.51 
 
 
461 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  23.81 
 
 
446 aa  91.3  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
445 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
462 aa  90.1  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  22.6 
 
 
456 aa  90.1  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.88 
 
 
470 aa  89.7  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.18 
 
 
538 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.73 
 
 
462 aa  89.7  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.97 
 
 
475 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.79 
 
 
498 aa  89.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  23.19 
 
 
441 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  26.39 
 
 
459 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  26.24 
 
 
451 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
469 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  23.83 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  21.5 
 
 
454 aa  87.4  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  26.24 
 
 
451 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  25.07 
 
 
453 aa  86.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
459 aa  86.7  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  24.51 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  24.76 
 
 
445 aa  85.9  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  23.66 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.58 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.58 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.58 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  24.85 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  24.85 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  23.43 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  22.74 
 
 
479 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.12 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.82 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.82 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
453 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
436 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  28.13 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  25.15 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  24.67 
 
 
474 aa  83.6  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.17 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  25.23 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.14 
 
 
518 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  22.7 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  22.88 
 
 
467 aa  82.4  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.33 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  26.53 
 
 
453 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  24.55 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  23.8 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  23.7 
 
 
499 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.33 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>