More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0308 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  100 
 
 		 441 aa  858    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  41.59 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  39.46 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  40.23 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 454 aa  136  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 462 aa  126  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 500 aa  124  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 518 aa  122  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.81 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 437 aa  117  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 499 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  28.46 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.62 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.17 
 
 		 469 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 461 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.43 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  21.69 
 
 		 480 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 451 aa  103  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  22.4 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 477 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  22.27 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  22.27 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 538 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  25.11 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  22.83 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  20.32 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  19.86 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 554 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 458 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 439 aa  96.7  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 448 aa  96.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 452 aa  96.3  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 481 aa  96.3  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  22.33 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  20.55 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  20.55 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  23.23 
 
 		 440 aa  94.4  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  23.28 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 464 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  22.82 
 
 		 458 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  19.63 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  19.63 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  21.92 
 
 		 478 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  19.63 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  26.32 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  19.63 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  19.63 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  19.86 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 490 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5728  hypothetical protein  24.68 
 
 		 470 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 457 aa  90.5  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.37 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  24.93 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  20.68 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 525 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  19.41 
 
 		 469 aa  87  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 447 aa  86.7  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 462 aa  86.7  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  20.45 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>