More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0848 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  99.56 
 
 		 458 aa  909    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  100 
 
 		 458 aa  911    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  39.69 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  36.76 
 
 		 456 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  32.59 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  32.59 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  35.19 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  31.38 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  30.53 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 479 aa  229  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  31.5 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  29.62 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 484 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  29.87 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  29.14 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  27.79 
 
 		 461 aa  193  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  26.7 
 
 		 461 aa  189  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  30.52 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 449 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  24.78 
 
 		 444 aa  133  6e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  25.17 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 467 aa  120  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.35 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.35 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 446 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 464 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.98 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  23.62 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 458 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 486 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 442 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 464 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  22.37 
 
 		 463 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 481 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  25.75 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  21.77 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  25.94 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  21.27 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 525 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 475 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 461 aa  99.8  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 453 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 456 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  21.92 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 481 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 454 aa  97.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  26.14 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  23.54 
 
 		 457 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  24.36 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  21.27 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  22.93 
 
 		 457 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  22.82 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  24.28 
 
 		 466 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  26.45 
 
 		 440 aa  93.2  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  24.83 
 
 		 428 aa  93.2  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  21.78 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  24.4 
 
 		 458 aa  92.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  20.94 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  22.07 
 
 		 446 aa  91.7  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 467 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 498 aa  90.9  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  22.4 
 
 		 450 aa  90.5  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  22.94 
 
 		 468 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 452 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 438 aa  89.7  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>