More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3948 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  93.67 
 
 		 458 aa  858    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  100 
 
 		 458 aa  906    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  60.63 
 
 		 484 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  59.73 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  56.03 
 
 		 457 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  53.1 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1507  mate efflux family protein  33.48 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  33.71 
 
 		 443 aa  247  4e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  33.97 
 
 		 457 aa  219  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  32.23 
 
 		 460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 454 aa  183  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  31.68 
 
 		 486 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 500 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  31.11 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 460 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 477 aa  157  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 554 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 451 aa  154  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  32.77 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 460 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  30.22 
 
 		 456 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.03 
 
 		 469 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 454 aa  149  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  27.03 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  27.03 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  27.03 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.77 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.64 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  27.03 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 452 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 452 aa  147  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  28.4 
 
 		 461 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 481 aa  146  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 518 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 538 aa  146  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 462 aa  146  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  28.66 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 525 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.91 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  31.25 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 477 aa  144  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 470 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 500 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.17 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 455 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 476 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.02 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 498 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  30.68 
 
 		 482 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 469 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.42 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  29.71 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>