More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3337 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  100 
 
 		 470 aa  903    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  57.26 
 
 		 485 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  54.42 
 
 		 499 aa  511  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  58.55 
 
 		 486 aa  497  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  51.93 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  53.89 
 
 		 498 aa  480  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  48.96 
 
 		 500 aa  435  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  49.49 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  43.1 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  40.98 
 
 		 525 aa  297  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  37.9 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  39.24 
 
 		 554 aa  289  7e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  39.96 
 
 		 538 aa  287  4e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  38.49 
 
 		 485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  34.68 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  36.69 
 
 		 500 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  34.75 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 462 aa  229  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  34.61 
 
 		 505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.39 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 460 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  32.89 
 
 		 451 aa  206  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  31.33 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 462 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29.7 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  32.36 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  30.95 
 
 		 521 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  28.26 
 
 		 463 aa  171  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  30.62 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  30.36 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  32.57 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 448 aa  166  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  31.04 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  31.12 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.01 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  29.94 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 494 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 469 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  30.96 
 
 		 457 aa  149  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  32.16 
 
 		 484 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.22 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.22 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.22 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 464 aa  147  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.98 
 
 		 469 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.11 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.98 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 469 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 469 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 470 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.89 
 
 		 469 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  28.82 
 
 		 482 aa  143  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 524 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  30.36 
 
 		 448 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 459 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 463 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  30.37 
 
 		 485 aa  136  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  29.31 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 446 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  27.5 
 
 		 458 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 457 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>