More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0618 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  100 
 
 		 505 aa  985    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  39.31 
 
 		 538 aa  331  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  39.45 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  36.63 
 
 		 498 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  38.7 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  39.52 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  36.86 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  36.27 
 
 		 481 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  35.97 
 
 		 525 aa  263  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  35.07 
 
 		 500 aa  261  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  34.32 
 
 		 486 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  34.66 
 
 		 490 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  31.01 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 468 aa  223  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  31.94 
 
 		 500 aa  219  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  31.39 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  34.61 
 
 		 470 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 445 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  30.27 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  28.72 
 
 		 451 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 460 aa  156  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 470 aa  153  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 453 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 475 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.1 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.63 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 464 aa  143  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 462 aa  143  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 453 aa  134  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 448 aa  130  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25 
 
 		 448 aa  130  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  24.27 
 
 		 496 aa  127  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 475 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 475 aa  126  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  25.26 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 466 aa  124  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 453 aa  123  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 468 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.16 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  23.99 
 
 		 469 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 467 aa  113  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.24 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  23.35 
 
 		 469 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  23.35 
 
 		 469 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  23.35 
 
 		 469 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.88 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 455 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  23.35 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  23.35 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  23.14 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.34 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  23.5 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  23.59 
 
 		 485 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 469 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 453 aa  103  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  25.25 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  23.47 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 480 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 457 aa  101  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>