More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3541 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 491 aa  962    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  58.61 
 
 		 471 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  52.97 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  52.31 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  52.24 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  52.31 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  52.7 
 
 		 449 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  54.05 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  51.49 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  41.24 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  39.79 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  40.81 
 
 		 469 aa  362  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  40.81 
 
 		 469 aa  362  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  39.96 
 
 		 469 aa  362  9e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  41.65 
 
 		 480 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  42.19 
 
 		 478 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  38.95 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  39.16 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  39.16 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  39.16 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  39.96 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  38.95 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  41.03 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  41.03 
 
 		 469 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  41.23 
 
 		 476 aa  333  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  40.22 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  37.73 
 
 		 496 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  36.43 
 
 		 492 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  35.12 
 
 		 521 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  36.71 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  35.29 
 
 		 494 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  34.62 
 
 		 524 aa  233  7.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  34.85 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  34.72 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  35.65 
 
 		 503 aa  219  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  36.19 
 
 		 465 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  43.46 
 
 		 270 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  36.6 
 
 		 481 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  35 
 
 		 238 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 453 aa  163  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 485 aa  148  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 446 aa  133  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 498 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 443 aa  126  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 460 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 449 aa  123  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  27.25 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  26.37 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.24 
 
 		 454 aa  114  5e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.73 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  31.04 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 456 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  21.65 
 
 		 455 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 538 aa  108  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.94 
 
 		 484 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 505 aa  107  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 554 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 462 aa  104  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.75 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  26.21 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>