More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1810 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  100 
 
 		 446 aa  878    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  38.63 
 
 		 442 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  34.1 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  34.93 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  37.09 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  31.09 
 
 		 477 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  34.45 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 500 aa  217  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  31.89 
 
 		 443 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  31.06 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 522 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  31.34 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  30.62 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  30.88 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  29.14 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  31.75 
 
 		 408 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 481 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.29 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  28.47 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 480 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 469 aa  143  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 485 aa  142  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.5 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.46 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.46 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.46 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.46 
 
 		 469 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.46 
 
 		 469 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 469 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 525 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.06 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  23.62 
 
 		 470 aa  136  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.21 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  24.06 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  24.76 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  24.81 
 
 		 482 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 438 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 538 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 462 aa  126  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 470 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  22.85 
 
 		 554 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 454 aa  123  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 503 aa  123  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 447 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 447 aa  119  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  25.34 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>