More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0835 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  100 
 
 		 438 aa  851    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  99.54 
 
 		 438 aa  843    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  36.94 
 
 		 463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 456 aa  216  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0636  MATE efflux family protein  33.96 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 460 aa  152  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 460 aa  127  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 445 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 468 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  26.02 
 
 		 443 aa  123  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  28.92 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  29.11 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  28.44 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2533  multi anti extrusion protein MatE  27.05 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000103349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  25.47 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 461 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 501 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 484 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 498 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 525 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 486 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 460 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  29 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 515 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 461 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 520 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 515 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 515 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 520 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 517 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.57 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  24.94 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 458 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 453 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 460 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  24.71 
 
 		 477 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 467 aa  98.2  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>