More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1820 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  100 
 
 		 461 aa  911    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 439 aa  148  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.67 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  28.68 
 
 		 457 aa  133  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25 
 
 		 447 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 458 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.82 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 438 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 438 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 457 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.61 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.98 
 
 		 456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  24.68 
 
 		 455 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  27.48 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 452 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 484 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  26.75 
 
 		 464 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 455 aa  112  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 447 aa  113  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  28.64 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  28.74 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  28.46 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  26.1 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.01 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 455 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 455 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 455 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 466 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 475 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.29 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 505 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  22.92 
 
 		 464 aa  106  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 442 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 458 aa  106  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.79 
 
 		 498 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>