More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1492 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  76.39 
 
 		 501 aa  737    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  72.21 
 
 		 515 aa  720    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  78.18 
 
 		 505 aa  754    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  78.36 
 
 		 503 aa  778    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  69.14 
 
 		 509 aa  686    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  73.89 
 
 		 531 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  72.21 
 
 		 515 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  72.62 
 
 		 520 aa  715    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  73.45 
 
 		 517 aa  710    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  71.66 
 
 		 521 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  72.21 
 
 		 515 aa  722    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  73.81 
 
 		 520 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  71.95 
 
 		 505 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  73.32 
 
 		 516 aa  708    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  72.41 
 
 		 515 aa  720    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  100 
 
 		 495 aa  972    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  49.48 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  49.43 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  48.18 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  46.79 
 
 		 443 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  47.88 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  45.05 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  44.47 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  45.67 
 
 		 434 aa  351  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  40.62 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  44.22 
 
 		 453 aa  336  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  43.01 
 
 		 481 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  42.89 
 
 		 493 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  41.06 
 
 		 479 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  42.63 
 
 		 491 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  43.12 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  43.01 
 
 		 481 aa  276  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  29.89 
 
 		 453 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  33.57 
 
 		 454 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  31.11 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  30.33 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 455 aa  153  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 460 aa  153  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  30.14 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.07 
 
 		 460 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  27.55 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  26.29 
 
 		 445 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  26 
 
 		 428 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  26 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  24.38 
 
 		 456 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 452 aa  133  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 478 aa  126  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 455 aa  123  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  26.36 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  25.3 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 466 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  25.76 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.73 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.11 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.59 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 454 aa  108  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 477 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 451 aa  106  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 453 aa  106  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  28.53 
 
 		 453 aa  106  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  24.07 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 500 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 458 aa  103  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>