More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3799 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
440 aa  859    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  60.23 
 
 
466 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  55.4 
 
 
442 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  53.39 
 
 
445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  56.06 
 
 
427 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  54.23 
 
 
444 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  50.34 
 
 
454 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  50.46 
 
 
443 aa  351  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  37.13 
 
 
462 aa  272  8.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  36.43 
 
 
453 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  33.63 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  32.27 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  33.33 
 
 
454 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  33.95 
 
 
459 aa  196  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  32.81 
 
 
456 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  32.8 
 
 
455 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  31.07 
 
 
454 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  31.87 
 
 
455 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  32.49 
 
 
455 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  32.49 
 
 
455 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  32.49 
 
 
455 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  30.94 
 
 
452 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  31.97 
 
 
453 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  35.65 
 
 
460 aa  186  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  29.31 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  32.21 
 
 
452 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  32.21 
 
 
452 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  31.98 
 
 
452 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  32.29 
 
 
455 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  33.49 
 
 
456 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  33.18 
 
 
428 aa  169  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  31.53 
 
 
476 aa  166  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
460 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  28.92 
 
 
467 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.73 
 
 
460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
460 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.04 
 
 
498 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.62 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  24.11 
 
 
516 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
500 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  23.79 
 
 
486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  24.66 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  26.56 
 
 
469 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.08 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.85 
 
 
458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.22 
 
 
499 aa  111  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  25.82 
 
 
465 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  24.76 
 
 
505 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  26.07 
 
 
453 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
460 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  23.39 
 
 
442 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  25.23 
 
 
501 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
485 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.74 
 
 
458 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  23.82 
 
 
515 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  23.58 
 
 
515 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  23.58 
 
 
515 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  23.58 
 
 
515 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
443 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.43 
 
 
486 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  23.88 
 
 
509 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.9 
 
 
468 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
531 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  25.24 
 
 
495 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.68 
 
 
463 aa  104  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
455 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.61 
 
 
475 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
455 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.7 
 
 
477 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  22.07 
 
 
453 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
458 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.52 
 
 
462 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  24.28 
 
 
454 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5248  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.82 
 
 
478 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
473 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
455 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.18 
 
 
456 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.2 
 
 
448 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  22.77 
 
 
503 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
457 aa  98.2  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  25.79 
 
 
463 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  23.88 
 
 
505 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
457 aa  97.8  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  26.94 
 
 
451 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  25.31 
 
 
449 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
521 aa  97.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.08 
 
 
518 aa  97.4  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
454 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
434 aa  96.7  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.2 
 
 
456 aa  96.7  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  22.91 
 
 
461 aa  96.7  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  23.59 
 
 
459 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  22.73 
 
 
447 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>