More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5118 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 453 aa  863    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  52.73 
 
 		 483 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  47.32 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  44.57 
 
 		 501 aa  340  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  43.48 
 
 		 505 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  44.11 
 
 		 520 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  43.88 
 
 		 517 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  43.88 
 
 		 520 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  45.24 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  44.22 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  42.4 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  43.42 
 
 		 515 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  43.42 
 
 		 515 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  43.42 
 
 		 515 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  43.42 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  46.6 
 
 		 479 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  45.52 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  42.03 
 
 		 521 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  43.19 
 
 		 531 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  46.81 
 
 		 493 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  42.82 
 
 		 509 aa  316  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  49.64 
 
 		 481 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  48 
 
 		 463 aa  312  6.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  47.17 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  44.76 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  46.57 
 
 		 493 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  44.21 
 
 		 486 aa  300  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  50.36 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  49.65 
 
 		 491 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  37.91 
 
 		 442 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  38.6 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  38.85 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  34.19 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  34.57 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  33.1 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  34.47 
 
 		 446 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  28.78 
 
 		 428 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 455 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 455 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 454 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  26.75 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  29.63 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  28.12 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 452 aa  91.3  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 462 aa  87.8  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 468 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 466 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.32 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  30.35 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.53 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  29.33 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  22.83 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  23.48 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.91 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  26.29 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>