More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6022 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6022  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 481 aa  889    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  0.0180252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7265  multi antimicrobial extrusion protein MatE  79.07 
 
 		 491 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2591  multi anti extrusion protein MatE  61.47 
 
 		 493 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  61.88 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3952  multi anti extrusion protein MatE  60.04 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.667584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2814  multi antimicrobial extrusion protein MatE  61.71 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  52.68 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2253  MATE efflux family protein  50.35 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  45.73 
 
 		 520 aa  350  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  44.59 
 
 		 517 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  43.04 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  47.71 
 
 		 483 aa  346  5e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  42.98 
 
 		 509 aa  343  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  44.34 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  50.93 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  45.14 
 
 		 516 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  40.29 
 
 		 521 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  44.57 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  44.57 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  44.57 
 
 		 515 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  44.57 
 
 		 515 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  43.52 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  43.02 
 
 		 505 aa  330  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  43.68 
 
 		 531 aa  326  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  44.5 
 
 		 495 aa  322  7e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  43.94 
 
 		 505 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  43.05 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  45.45 
 
 		 465 aa  306  7e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  39.37 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  41.91 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  35.45 
 
 		 442 aa  285  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  43.62 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3037  hypothetical protein  36.91 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0928609  normal  0.0798256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0370  MATE efflux family protein  36.47 
 
 		 458 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3172  hypothetical protein  38.33 
 
 		 453 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0893735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2187  multi anti extrusion protein MatE  35.82 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761127  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  30.66 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 451 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  33.09 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  25.11 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 452 aa  123  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  27.23 
 
 		 460 aa  123  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  25.58 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 452 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 478 aa  97.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.8 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 518 aa  94.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25 
 
 		 477 aa  94.4  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 442 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 454 aa  90.9  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 453 aa  90.1  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 453 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  19.62 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.67 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.08 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  29.37 
 
 		 444 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  30 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  30.85 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  22.4 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.73 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  30.27 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  21.65 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  22.85 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>