More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0249 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  69.52 
 
 		 442 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  70.52 
 
 		 445 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  876    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  71.19 
 
 		 427 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  54.82 
 
 		 454 aa  472  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  55.58 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  45.54 
 
 		 443 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  36.79 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  33.79 
 
 		 453 aa  230  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  33.87 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  34.03 
 
 		 454 aa  209  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  31.49 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  31.49 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 455 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  32.32 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  31.64 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  31.78 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  30.12 
 
 		 454 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  33.65 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  32.79 
 
 		 460 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  30.4 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 515 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 515 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 515 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 501 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 516 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 517 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 505 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 521 aa  123  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 495 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 443 aa  116  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 462 aa  114  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 505 aa  113  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 531 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  23.86 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  28.28 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  23.96 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  25 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  22.79 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  21.7 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  23.52 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.39 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 486 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  22.68 
 
 		 498 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 462 aa  100  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 467 aa  96.3  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 447 aa  96.3  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 467 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2619  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.47 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  24.56 
 
 		 478 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 454 aa  94  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 500 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  24.26 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>