More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1953 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  100 
 
 		 454 aa  889    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  65.92 
 
 		 473 aa  585  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  60.8 
 
 		 467 aa  558  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  59.16 
 
 		 455 aa  541  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  42.67 
 
 		 478 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  42.14 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  40.27 
 
 		 460 aa  349  6e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  39.95 
 
 		 460 aa  348  9e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  39.5 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  43.49 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  39.27 
 
 		 457 aa  333  3e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  40.8 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  37 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  38.89 
 
 		 437 aa  293  5e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  39.12 
 
 		 437 aa  292  7e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  63.44 
 
 		 190 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.38 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  39.5 
 
 		 210 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 453 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 439 aa  136  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 462 aa  136  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  26.24 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 460 aa  126  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 468 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 458 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.43 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.59 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 525 aa  114  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.33 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  24.48 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  25 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.11 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 451 aa  108  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 554 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  32 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  32 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 463 aa  106  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.85 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.85 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  21.64 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.85 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 467 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.45 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 469 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 472 aa  103  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.62 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.62 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  26.67 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>