More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1142 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  100 
 
 
458 aa  898    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  50.11 
 
 
460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  48.56 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  49 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  49.89 
 
 
457 aa  432  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  45.37 
 
 
437 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  45.6 
 
 
437 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  42.63 
 
 
485 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  41.69 
 
 
478 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  43.78 
 
 
454 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  40.78 
 
 
473 aa  353  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  40.8 
 
 
454 aa  340  4e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  41.43 
 
 
467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  38.94 
 
 
455 aa  319  5e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  37.36 
 
 
470 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  32.75 
 
 
460 aa  216  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  30.68 
 
 
455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  31.74 
 
 
468 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  30.39 
 
 
456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
455 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
455 aa  170  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  29 
 
 
456 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  30.9 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  30.3 
 
 
459 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
477 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  30.07 
 
 
460 aa  156  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.96 
 
 
461 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  28.57 
 
 
451 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.77 
 
 
453 aa  154  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  30.02 
 
 
455 aa  153  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
453 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
451 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.66 
 
 
475 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.25 
 
 
460 aa  150  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  29.05 
 
 
455 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  32.25 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
451 aa  147  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  29.47 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  28.28 
 
 
446 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
458 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
460 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
447 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  29.38 
 
 
454 aa  145  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  29.51 
 
 
439 aa  145  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
451 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
477 aa  144  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  28.95 
 
 
475 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
458 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  29.2 
 
 
467 aa  143  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
466 aa  143  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  26.55 
 
 
467 aa  143  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.86 
 
 
456 aa  143  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.97 
 
 
525 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.13 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.28 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  26.79 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.86 
 
 
447 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.84 
 
 
490 aa  139  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
538 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.66 
 
 
458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
449 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.91 
 
 
442 aa  137  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
481 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.06 
 
 
554 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.04 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.58 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
454 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.63 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  27.81 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
499 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.63 
 
 
464 aa  134  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
472 aa  133  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  30.03 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36.96 
 
 
190 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  28.39 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  25.95 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  24.46 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.16 
 
 
475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  27.01 
 
 
443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
469 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.69 
 
 
500 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  28.14 
 
 
440 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  24.61 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.92 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  29.23 
 
 
447 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.89 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.83 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.12 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  33.67 
 
 
210 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  27.93 
 
 
442 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.57 
 
 
456 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>