93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0849 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  75.13 
 
 		 467 aa  298  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  63.44 
 
 		 454 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  59.14 
 
 		 455 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  54.84 
 
 		 473 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  37.22 
 
 		 485 aa  145  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  37.97 
 
 		 437 aa  144  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  37.97 
 
 		 437 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  37.1 
 
 		 478 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  42.08 
 
 		 470 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  40.88 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  36.96 
 
 		 458 aa  132  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  33.15 
 
 		 460 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  31.52 
 
 		 460 aa  124  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  33.15 
 
 		 454 aa  124  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  34.48 
 
 		 457 aa  124  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  31.52 
 
 		 460 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.97 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 475 aa  62  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 455 aa  58.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  22.78 
 
 		 470 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 525 aa  55.1  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 554 aa  54.3  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  23.66 
 
 		 451 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  21.52 
 
 		 458 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  22.29 
 
 		 477 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  20.89 
 
 		 458 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 457 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 453 aa  51.6  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  22.91 
 
 		 466 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25 
 
 		 464 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 499 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 466 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  20.54 
 
 		 455 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  20.54 
 
 		 455 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  25.41 
 
 		 427 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 442 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 461 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  22.93 
 
 		 463 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25 
 
 		 461 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 454 aa  48.9  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  22.5 
 
 		 464 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  20.77 
 
 		 484 aa  48.5  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 463 aa  48.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 481 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 485 aa  47.8  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 478 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  21.97 
 
 		 467 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  24.49 
 
 		 496 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  23.89 
 
 		 445 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 498 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.11 
 
 		 466 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  25 
 
 		 493 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 457 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1507  mate efflux family protein  26.4 
 
 		 446 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 455 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  27.53 
 
 		 472 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 454 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  22.28 
 
 		 412 aa  45.1  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 483 aa  44.7  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 480 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2533  multi anti extrusion protein MatE  25.74 
 
 		 447 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000103349  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 485 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  24.04 
 
 		 454 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.1 
 
 		 469 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22.1 
 
 		 469 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  19.77 
 
 		 456 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22.1 
 
 		 469 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  20.83 
 
 		 456 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  20.99 
 
 		 469 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  22.1 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.14 
 
 		 452 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  22.1 
 
 		 469 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.1 
 
 		 469 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 451 aa  42.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  19.65 
 
 		 453 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.43 
 
 		 467 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 449 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 449 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 447 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 470 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  22.1 
 
 		 469 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  21.55 
 
 		 469 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 453 aa  41.6  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  19.77 
 
 		 454 aa  42  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 440 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  21.31 
 
 		 453 aa  41.6  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  17.68 
 
 		 466 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  20 
 
 		 462 aa  41.6  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 454 aa  41.2  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  28.46 
 
 		 452 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>