More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1507 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1507  mate efflux family protein  100 
 
 
446 aa  880    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  63.57 
 
 
443 aa  550  1e-155  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  35.96 
 
 
484 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  35.83 
 
 
463 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  33.71 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  33.48 
 
 
458 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  34.52 
 
 
457 aa  243  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  32.28 
 
 
470 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  36.34 
 
 
457 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.8 
 
 
460 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
461 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.69 
 
 
453 aa  126  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  28.79 
 
 
448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.88 
 
 
454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.55 
 
 
452 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
468 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  23.43 
 
 
455 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
451 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  26.65 
 
 
456 aa  113  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  23.23 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.41 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.69 
 
 
455 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  23.27 
 
 
451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.21 
 
 
460 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.22 
 
 
452 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
439 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  23.19 
 
 
460 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.87 
 
 
451 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
486 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.54 
 
 
461 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.81 
 
 
499 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.81 
 
 
485 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  23.19 
 
 
455 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  21.97 
 
 
454 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  22.95 
 
 
455 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.81 
 
 
477 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  22.95 
 
 
455 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  23.88 
 
 
452 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  22.95 
 
 
455 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  22.73 
 
 
475 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  24.28 
 
 
485 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  24.59 
 
 
477 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  27.99 
 
 
460 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.32 
 
 
470 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  24.37 
 
 
447 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.14 
 
 
447 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.33 
 
 
485 aa  100  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  27.17 
 
 
428 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.43 
 
 
438 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  24.1 
 
 
467 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  23.95 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.44 
 
 
454 aa  99  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  21.18 
 
 
462 aa  97.4  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  23.33 
 
 
478 aa  97.1  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  23.17 
 
 
457 aa  96.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  21.97 
 
 
453 aa  96.7  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  24.13 
 
 
456 aa  96.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  23.88 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.76 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.33 
 
 
453 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  23.83 
 
 
503 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  22.94 
 
 
459 aa  94.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  24.13 
 
 
452 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  20.88 
 
 
469 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
451 aa  94.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
451 aa  94.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  21.85 
 
 
460 aa  94.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
448 aa  94  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  23.88 
 
 
452 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.25 
 
 
450 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  23.99 
 
 
449 aa  93.6  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  22.6 
 
 
475 aa  93.2  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  23.12 
 
 
469 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.14 
 
 
475 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  23.21 
 
 
477 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.51 
 
 
468 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  21.72 
 
 
446 aa  92  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  23.99 
 
 
461 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  22.97 
 
 
469 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.9 
 
 
437 aa  91.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.68 
 
 
451 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  22.83 
 
 
469 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  23.17 
 
 
460 aa  90.9  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  23.74 
 
 
451 aa  90.5  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25.31 
 
 
446 aa  90.5  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  22.25 
 
 
463 aa  90.1  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.37 
 
 
500 aa  90.1  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  25.52 
 
 
446 aa  89.7  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.21 
 
 
458 aa  89.7  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  22.29 
 
 
496 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.29 
 
 
518 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
463 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
464 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  23.04 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.22 
 
 
469 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22.38 
 
 
469 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22.38 
 
 
469 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>