More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0031 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  100 
 
 		 503 aa  999    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  81.15 
 
 		 524 aa  769    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  54.18 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  48.98 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  48.2 
 
 		 492 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  48.59 
 
 		 486 aa  402  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  47.69 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  47.68 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  46.54 
 
 		 521 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  49.89 
 
 		 481 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  42.31 
 
 		 482 aa  319  6e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  35.73 
 
 		 469 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  34.93 
 
 		 469 aa  297  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  35.73 
 
 		 469 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  34.64 
 
 		 469 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  34.42 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  34.2 
 
 		 469 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  34.2 
 
 		 469 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  34.2 
 
 		 469 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  34.42 
 
 		 469 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  34.2 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  33.77 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  35.37 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  35.37 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  34.79 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  34.35 
 
 		 480 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  36.6 
 
 		 476 aa  251  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  36.71 
 
 		 491 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  37.76 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  36.7 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  36.7 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  35.54 
 
 		 449 aa  233  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  35.76 
 
 		 471 aa  233  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  34.1 
 
 		 458 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  34.17 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  34.71 
 
 		 436 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  33.94 
 
 		 472 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.76 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 460 aa  174  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  34.35 
 
 		 270 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 442 aa  150  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  34.33 
 
 		 238 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  32.76 
 
 		 500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 454 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 490 aa  141  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 475 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25 
 
 		 538 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 462 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 453 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.2 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  22.79 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 446 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 445 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 470 aa  127  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.11 
 
 		 463 aa  124  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 522 aa  123  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 453 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 467 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 445 aa  119  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.13 
 
 		 462 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  27.97 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  22.68 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  27.38 
 
 		 446 aa  117  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  23.14 
 
 		 505 aa  116  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  22.49 
 
 		 518 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  26.67 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.81 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  23.05 
 
 		 498 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  28.43 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>