More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2639 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  100 
 
 		 481 aa  946    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  50.54 
 
 		 524 aa  430  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  48.76 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  49.89 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  49.38 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  47.49 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  49.57 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  46.38 
 
 		 486 aa  359  8e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  45.25 
 
 		 521 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  45.78 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  40.5 
 
 		 482 aa  297  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  32.98 
 
 		 469 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 469 aa  253  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  32.98 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  32.98 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  32.98 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  32.98 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  32.98 
 
 		 469 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  32.77 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  32.77 
 
 		 469 aa  247  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  36.24 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  34.17 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  34.17 
 
 		 469 aa  225  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  35.33 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  34.39 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  36.55 
 
 		 436 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  34.16 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  34.16 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  35.36 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  32.52 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  31.3 
 
 		 478 aa  209  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  34.15 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  33.93 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  34.31 
 
 		 458 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  32.58 
 
 		 472 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 448 aa  169  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 442 aa  153  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 448 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 485 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 470 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  35.29 
 
 		 270 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 500 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  22.77 
 
 		 475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 446 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.15 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 468 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 461 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 525 aa  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26 
 
 		 498 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 538 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  32.48 
 
 		 238 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  29.65 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  29.38 
 
 		 477 aa  113  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 505 aa  110  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 500 aa  110  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.57 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.04 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.48 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  29.43 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.9 
 
 		 518 aa  107  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 452 aa  107  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 468 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 485 aa  106  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.3 
 
 		 454 aa  106  9e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.23 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 463 aa  103  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  21.66 
 
 		 475 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  27.1 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>