More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18080 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  100 
 
 		 468 aa  933    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  36.36 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  32.11 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  33.02 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  30.27 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  30 
 
 		 446 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  28.54 
 
 		 477 aa  140  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  31.13 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  26.67 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  30.82 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 442 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29.98 
 
 		 496 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.62 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  28.4 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  30.65 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  24.58 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.87 
 
 		 469 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 462 aa  110  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 454 aa  110  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  32.32 
 
 		 482 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.62 
 
 		 469 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.2 
 
 		 469 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.2 
 
 		 469 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.2 
 
 		 469 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 475 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.2 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.2 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  26.75 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  30.03 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  25 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  25 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 486 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  32.34 
 
 		 437 aa  106  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  31.91 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  26.53 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  32.38 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 469 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  24.81 
 
 		 449 aa  100  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 486 aa  99.8  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 460 aa  99.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 480 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  25.89 
 
 		 491 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 485 aa  97.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  30.8 
 
 		 485 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 524 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 525 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  24.8 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 458 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 467 aa  94.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 458 aa  94  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 481 aa  94  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  22.42 
 
 		 456 aa  93.2  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  29.5 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 438 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  22.48 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.39 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 454 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  22.16 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>