More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1597 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 408 aa  813    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  53.11 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  43.98 
 
 		 477 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  43.72 
 
 		 446 aa  329  5.0000000000000004e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  43.94 
 
 		 522 aa  301  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  43.5 
 
 		 494 aa  296  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  39.8 
 
 		 500 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  40.6 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  35.59 
 
 		 453 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  30.53 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  32.9 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  35.94 
 
 		 451 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  32.82 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  33.62 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  31.75 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 443 aa  179  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  31.99 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  30.85 
 
 		 448 aa  149  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 446 aa  142  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 524 aa  126  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29.13 
 
 		 496 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  33.46 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  24.82 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  32.55 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  29.54 
 
 		 471 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.54 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  30.82 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  26.8 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  26.86 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  26.86 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  26.86 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  27.6 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  26.86 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  28.05 
 
 		 482 aa  106  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  27.53 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.21 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  29.51 
 
 		 494 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 554 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  30.4 
 
 		 503 aa  97.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 480 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 485 aa  96.3  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 478 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  24.63 
 
 		 491 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 458 aa  93.6  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 521 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  22.29 
 
 		 454 aa  90.1  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 460 aa  90.1  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  27.24 
 
 		 458 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  24.92 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  28.52 
 
 		 476 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  25.08 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 461 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 463 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 473 aa  86.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.35 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  26.42 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.91 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 538 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  25.24 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  25.14 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1507  mate efflux family protein  26.05 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  25 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  22.01 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0636  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  27.94 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  24.44 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  26.54 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>