More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3019 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  100 
 
 		 453 aa  904    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  42.34 
 
 		 477 aa  349  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  40.94 
 
 		 458 aa  323  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  40.49 
 
 		 522 aa  315  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  40.37 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  40.15 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  37.69 
 
 		 445 aa  295  8e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  38.63 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  40.28 
 
 		 494 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  40.6 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  36.2 
 
 		 446 aa  272  9e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  31.89 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  36.05 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  33.72 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  33.78 
 
 		 457 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  35.18 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  36.41 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 446 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  31.46 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 469 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  29.1 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  29.1 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  29.1 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  28.88 
 
 		 469 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.1 
 
 		 469 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  29.1 
 
 		 469 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  28.13 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 469 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  30 
 
 		 478 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 452 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  30 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  30.88 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 455 aa  146  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 454 aa  146  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  29.97 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 448 aa  143  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  29.15 
 
 		 482 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 476 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 467 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 524 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 503 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 500 aa  133  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  27.36 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.78 
 
 		 496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  29.28 
 
 		 503 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  27.75 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  27.88 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 477 aa  127  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.45 
 
 		 458 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 457 aa  126  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 490 aa  126  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  28.8 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  27.22 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.54 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 538 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.95 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 452 aa  123  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 525 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  34.98 
 
 		 238 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 456 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>