More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1922 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  100 
 
 		 456 aa  912    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  44.85 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  34.75 
 
 		 463 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  32.89 
 
 		 454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 438 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 438 aa  216  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0636  MATE efflux family protein  30.51 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 458 aa  150  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 460 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 464 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 448 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  25.3 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  26.81 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2533  multi anti extrusion protein MatE  24.35 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000103349  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 485 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 443 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  25.66 
 
 		 477 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 453 aa  113  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 442 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  24.66 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 525 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 518 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  23.69 
 
 		 472 aa  106  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.73 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.95 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.95 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.89 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  22.22 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  23.73 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.22 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  23.57 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  22.75 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 450 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  23.89 
 
 		 496 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.51 
 
 		 554 aa  99.8  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 500 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 522 aa  98.2  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 451 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  25.14 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 460 aa  97.8  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  24.26 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 445 aa  96.7  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>