More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05890 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  100 
 
 		 472 aa  930    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  35.21 
 
 		 475 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 483 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 458 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  32.08 
 
 		 468 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 461 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  30.31 
 
 		 452 aa  117  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  31.11 
 
 		 453 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 453 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  32.04 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  22.59 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  24.46 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  22.7 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25.05 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  27.88 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  22.73 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.4 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.4 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  24.9 
 
 		 502 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  22.96 
 
 		 546 aa  108  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.4 
 
 		 546 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.4 
 
 		 547 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  26 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.4 
 
 		 547 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  24.63 
 
 		 484 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.03 
 
 		 484 aa  106  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 456 aa  106  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  23.53 
 
 		 480 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  22.05 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  25.97 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  25.79 
 
 		 474 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 451 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  25 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  26.37 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 554 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  26.7 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2383  multidrug resistance protein  28.04 
 
 		 451 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2217  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 451 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2255  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 451 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  25.58 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 450 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 450 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  25.32 
 
 		 457 aa  100  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 450 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  29.39 
 
 		 471 aa  99.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1371  multidrug resistance protein NorM, putative  27.83 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31883  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  29.39 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2211  multidrug resistance protein NorM, putative  27.61 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0676191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1862  putative multidrug resistance protein NorM  27.83 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0035  putative multidrug resistance protein NorM  27.83 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0708926  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1133  putative multidrug resistance protein NorM  27.83 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 444 aa  99  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 498 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 450 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 518 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 457 aa  97.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 485 aa  96.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 442 aa  96.7  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  22.13 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  24.95 
 
 		 471 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 486 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>