More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0162 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  100 
 
 		 486 aa  937    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  31.33 
 
 		 460 aa  213  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  31.96 
 
 		 457 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  35.37 
 
 		 471 aa  205  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  31.96 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  31.96 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  32.26 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  34.38 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  35.15 
 
 		 471 aa  203  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  30.97 
 
 		 454 aa  202  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 450 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  36.05 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  28.95 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  30.49 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  34.08 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  30.16 
 
 		 461 aa  192  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  29.2 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  36.09 
 
 		 467 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  29.54 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  30.43 
 
 		 457 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  30.43 
 
 		 457 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  29.48 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.52 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  30.43 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  30.43 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  30.43 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  29.98 
 
 		 457 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  29.98 
 
 		 457 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  29.91 
 
 		 456 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 457 aa  186  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 457 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  29.73 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  35.05 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  30.66 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  30.68 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  29.96 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 453 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  29.71 
 
 		 458 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  32.32 
 
 		 474 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  31.47 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  29.5 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1009  MATE efflux family protein  35.01 
 
 		 464 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  35.29 
 
 		 468 aa  176  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  31.53 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  33.19 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  31.53 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1006  MATE efflux family protein  35.15 
 
 		 469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  30.12 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  33.33 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 470 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  34.82 
 
 		 451 aa  173  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  32.86 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  32.86 
 
 		 462 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  28.96 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  31.71 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  32.79 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0948  MATE efflux family protein  35.08 
 
 		 464 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  32.51 
 
 		 462 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  32.3 
 
 		 461 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 453 aa  169  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  29.47 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  29.93 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  33.11 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  31.52 
 
 		 470 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0988  MATE efflux family protein  35.73 
 
 		 470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 459 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 453 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  31.7 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  33.11 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  33.11 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  33.11 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  33.11 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  33.11 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  33.11 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00581  MATE efflux family protein (Eurofung)  30.29 
 
 		 622 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  33.18 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 459 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  31.94 
 
 		 462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>