More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0971 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  84.5 
 
 		 468 aa  744    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  84.5 
 
 		 468 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  84.5 
 
 		 468 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  79.96 
 
 		 463 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  84.5 
 
 		 468 aa  745    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  100 
 
 		 462 aa  887    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  84.28 
 
 		 468 aa  743    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  94.13 
 
 		 462 aa  819    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  83.98 
 
 		 464 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  94.37 
 
 		 462 aa  826    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  78.27 
 
 		 470 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  78.94 
 
 		 470 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  93.94 
 
 		 462 aa  822    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  93.94 
 
 		 462 aa  822    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  99.78 
 
 		 462 aa  885    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  93.94 
 
 		 462 aa  822    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  84.5 
 
 		 468 aa  745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  84.5 
 
 		 468 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  40.9 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  40.9 
 
 		 471 aa  285  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0418  MATE efflux family protein  45.88 
 
 		 448 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0686171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  39.42 
 
 		 470 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  38.68 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  39.82 
 
 		 460 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  38.32 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  38.22 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  39.46 
 
 		 461 aa  239  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  37.61 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  39.61 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  37.39 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  40.59 
 
 		 468 aa  237  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  38.67 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  38.32 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  40.05 
 
 		 460 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  38.32 
 
 		 462 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  37.96 
 
 		 460 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  38.1 
 
 		 469 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  37.61 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  36.3 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  37.81 
 
 		 462 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  34.21 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  36.5 
 
 		 467 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  35.62 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  38.91 
 
 		 488 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  37 
 
 		 472 aa  220  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  36.77 
 
 		 472 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  35.04 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  38.55 
 
 		 490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  35.87 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  34.3 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  36.53 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  33.56 
 
 		 458 aa  206  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  39.08 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  34.32 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  34.32 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  33.62 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  34.55 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  30.33 
 
 		 453 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  36.61 
 
 		 451 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  30.11 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  30.11 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  30.55 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  30.11 
 
 		 453 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  30.84 
 
 		 453 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  34.25 
 
 		 467 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  36.38 
 
 		 451 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  33.95 
 
 		 453 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  34.48 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  32.51 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  29.8 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  30.2 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  29.67 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  35.52 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  31.31 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  33.93 
 
 		 457 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  30.45 
 
 		 460 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  34.25 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  29.67 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  32.81 
 
 		 457 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  31.93 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  32.2 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  29.76 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  29.89 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  34.09 
 
 		 466 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  31.76 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  30.88 
 
 		 460 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 442 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  30.12 
 
 		 455 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  32.05 
 
 		 457 aa  186  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  34.92 
 
 		 463 aa  186  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  31.03 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  31.03 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  31.03 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  31.32 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>