More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0676 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  91.08 
 
 		 477 aa  786    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  99.58 
 
 		 472 aa  888    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  100 
 
 		 472 aa  893    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  42.6 
 
 		 471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  42.6 
 
 		 471 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  42.11 
 
 		 470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  44.59 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  44.71 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  42.38 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  46.41 
 
 		 468 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  43.44 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  43.67 
 
 		 490 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  43.36 
 
 		 477 aa  300  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  40.7 
 
 		 467 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  41.83 
 
 		 474 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  41.24 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  43.52 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  41.44 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  43.28 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  42.69 
 
 		 453 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  38.36 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  39.82 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  38.29 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  37.04 
 
 		 472 aa  257  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  40.4 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  40 
 
 		 470 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  39.23 
 
 		 460 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  38.24 
 
 		 467 aa  246  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  38.21 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  40.39 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  38.01 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  37.93 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  37.93 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  37.93 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  37 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  37.58 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  36.77 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  38.09 
 
 		 464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  36.88 
 
 		 462 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  38.34 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  38.12 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  38.12 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  38.12 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  38.12 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  38.12 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  37.56 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  36.56 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  36.54 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  34.23 
 
 		 460 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  35.57 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  34.34 
 
 		 464 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  34.24 
 
 		 462 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  34.16 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  35.97 
 
 		 488 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  34.99 
 
 		 462 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  33.11 
 
 		 460 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  35.53 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  30.15 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  34.99 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  34.69 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  33.12 
 
 		 466 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  28.6 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  33.12 
 
 		 462 aa  180  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  31.14 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 442 aa  173  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  32.6 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  26.95 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  27.41 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  27.41 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  27.41 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  27.41 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  26.21 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  26.71 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  26.98 
 
 		 452 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  26.69 
 
 		 480 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  30.56 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1009  MATE efflux family protein  34.44 
 
 		 464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  26.9 
 
 		 457 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  30.56 
 
 		 477 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  28.05 
 
 		 452 aa  156  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  26.71 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  26.25 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  29.32 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  28.79 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  27.19 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  26.43 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  28.2 
 
 		 457 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1006  MATE efflux family protein  33.81 
 
 		 469 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  26.27 
 
 		 452 aa  153  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  28.6 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  27.98 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  27.98 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  27.98 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>