More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2036 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  100 
 
 
464 aa  937    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  42.51 
 
 
458 aa  359  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  41.46 
 
 
460 aa  355  6.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  40.62 
 
 
457 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  40.85 
 
 
457 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  40.85 
 
 
457 aa  345  8e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  40.85 
 
 
457 aa  345  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  42.21 
 
 
457 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  40.86 
 
 
456 aa  339  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  39.96 
 
 
457 aa  339  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  41.93 
 
 
457 aa  339  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  41.22 
 
 
457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  40 
 
 
461 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  41.03 
 
 
456 aa  332  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  39.82 
 
 
457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  40.72 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  39.82 
 
 
457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  39.82 
 
 
457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  39.82 
 
 
457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  39.82 
 
 
457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  39.64 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  39.82 
 
 
457 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  39.82 
 
 
457 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  39.37 
 
 
458 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  40.31 
 
 
457 aa  326  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  40.31 
 
 
457 aa  326  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  39.65 
 
 
457 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  39.43 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  39.55 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  39.43 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  39.43 
 
 
457 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  39.21 
 
 
457 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  39.56 
 
 
459 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  40.35 
 
 
459 aa  317  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  40.44 
 
 
459 aa  317  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  40.44 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  40.22 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  39.43 
 
 
459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  39.34 
 
 
459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  39.39 
 
 
459 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  39.39 
 
 
459 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  37.38 
 
 
425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  37.42 
 
 
472 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  38.14 
 
 
453 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  36.95 
 
 
466 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  35.65 
 
 
460 aa  300  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  37.01 
 
 
480 aa  299  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  37.42 
 
 
461 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  39.55 
 
 
453 aa  296  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  36.12 
 
 
477 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  35.4 
 
 
455 aa  276  4e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  36.12 
 
 
477 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  37.02 
 
 
454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  35.17 
 
 
455 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  34.6 
 
 
457 aa  272  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  36.18 
 
 
457 aa  267  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  36.36 
 
 
478 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  34.59 
 
 
461 aa  263  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  37.07 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  34.6 
 
 
456 aa  259  9e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  36.11 
 
 
464 aa  257  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  35.9 
 
 
475 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  34.78 
 
 
441 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  31.13 
 
 
450 aa  206  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  27.56 
 
 
453 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  34 
 
 
454 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  28.44 
 
 
452 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  27.56 
 
 
453 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  27.56 
 
 
453 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  29 
 
 
465 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  32.39 
 
 
459 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  27.88 
 
 
457 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  27.56 
 
 
453 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  26.91 
 
 
455 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  28 
 
 
452 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  27.59 
 
 
454 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  31.73 
 
 
453 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  31.79 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  32.09 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  31.79 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1115  MATE efflux family protein  29.6 
 
 
448 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000487521  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  27.33 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  27.42 
 
 
452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  29.65 
 
 
462 aa  197  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  32.25 
 
 
459 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1023  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
448 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00302987  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  27.11 
 
 
452 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  31.39 
 
 
448 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2139  MATE efflux family protein  31.99 
 
 
449 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000263742  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  32.31 
 
 
451 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  27.81 
 
 
453 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  32.06 
 
 
470 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  29.91 
 
 
449 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  31.63 
 
 
460 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  29.75 
 
 
450 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  27.86 
 
 
461 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3309  MATE efflux family protein  32.89 
 
 
479 aa  187  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  31.85 
 
 
463 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  31.22 
 
 
470 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  31.57 
 
 
450 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>