More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1298 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  100 
 
 		 467 aa  910    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  58.85 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  59.38 
 
 		 470 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  55.51 
 
 		 460 aa  498  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  58.85 
 
 		 490 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  59.41 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  53.85 
 
 		 470 aa  488  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  54.28 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  54.5 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  52.31 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  44.96 
 
 		 472 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  44.96 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  42.58 
 
 		 477 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  43.17 
 
 		 463 aa  320  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  40.63 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  42.03 
 
 		 470 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  38.49 
 
 		 465 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  40.96 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  41.02 
 
 		 467 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  40.45 
 
 		 460 aa  293  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  40.62 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  42.04 
 
 		 470 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  41.12 
 
 		 456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  40.54 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  40.54 
 
 		 451 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  41.19 
 
 		 469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  37.89 
 
 		 472 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  40.5 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  35.89 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  38.36 
 
 		 468 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  38.6 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  38.94 
 
 		 464 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  38.39 
 
 		 468 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  38.39 
 
 		 468 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  38.39 
 
 		 468 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  38.39 
 
 		 468 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  38.39 
 
 		 468 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  38.18 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  38.56 
 
 		 463 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  37.74 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  37.66 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  37.66 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  37.66 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  37.61 
 
 		 462 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  37.39 
 
 		 462 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  38.21 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  37.45 
 
 		 470 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  37.29 
 
 		 470 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  37.78 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  36.81 
 
 		 464 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  36.1 
 
 		 461 aa  226  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  34.88 
 
 		 462 aa  223  6e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  33.48 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  32.16 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  33.48 
 
 		 457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  33.48 
 
 		 457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  35.09 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  35.09 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  35.12 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  35.12 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  36.75 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  35.1 
 
 		 457 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  33.04 
 
 		 456 aa  217  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  34.78 
 
 		 466 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  35.41 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  35.12 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  35.12 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  33.04 
 
 		 456 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  35.12 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  35.12 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  37.08 
 
 		 462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  37.78 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  34.51 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  36.22 
 
 		 462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  37.05 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  37.78 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  36.03 
 
 		 486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  31.88 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  33.64 
 
 		 455 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  32.54 
 
 		 458 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  34.65 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  34.65 
 
 		 457 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  34.29 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  34.65 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  34.65 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  34.74 
 
 		 466 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  32.82 
 
 		 457 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 442 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  30.65 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  30.65 
 
 		 453 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  30.65 
 
 		 453 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  31.26 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  31.03 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  31.72 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  33.03 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  31.72 
 
 		 452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  31.72 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  29.31 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>