More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1856 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  71.55 
 
 		 457 aa  675    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  75.71 
 
 		 457 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  74.62 
 
 		 457 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  100 
 
 		 457 aa  911    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  75.71 
 
 		 457 aa  695    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  75.71 
 
 		 457 aa  696    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  74.84 
 
 		 457 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  74.62 
 
 		 457 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  75.93 
 
 		 457 aa  696    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  74.4 
 
 		 457 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  72.65 
 
 		 457 aa  672    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  74.4 
 
 		 457 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  72.93 
 
 		 457 aa  664    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  72.26 
 
 		 457 aa  656    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  75.71 
 
 		 457 aa  697    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  78.38 
 
 		 458 aa  732    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  74.4 
 
 		 457 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  99.78 
 
 		 457 aa  910    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  100 
 
 		 457 aa  911    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  75.71 
 
 		 457 aa  696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  75.71 
 
 		 457 aa  697    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  75.49 
 
 		 457 aa  693    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  75.49 
 
 		 457 aa  693    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  58.74 
 
 		 456 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  57.49 
 
 		 460 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  57.85 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  54.92 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  53.24 
 
 		 461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  52.5 
 
 		 452 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  52.47 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  52.7 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  52.02 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  51.46 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  52.02 
 
 		 459 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  52.05 
 
 		 459 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  52.27 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  52.05 
 
 		 459 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  51.11 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  52.27 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  52.27 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  51.82 
 
 		 459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  52.05 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  52.49 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  50.23 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  49.1 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  51.01 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  46.36 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  47.82 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  49.31 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  45.56 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  47.17 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  45.54 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  45.54 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  46.64 
 
 		 459 aa  342  9e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  44.25 
 
 		 475 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  40.13 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  41.43 
 
 		 464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  40.85 
 
 		 464 aa  323  3e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  39.91 
 
 		 461 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  39.18 
 
 		 455 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  38.5 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  38.91 
 
 		 456 aa  295  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  37.16 
 
 		 455 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  35.07 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  34.84 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  35.47 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  34.84 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  35.52 
 
 		 452 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  35.51 
 
 		 449 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  34.84 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  35.24 
 
 		 453 aa  272  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  34.55 
 
 		 452 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  34.01 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  34.39 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  32.09 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  34.31 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3309  MATE efflux family protein  39.56 
 
 		 479 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2429  multidrug efflux protein  37.19 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  36.88 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  36.83 
 
 		 454 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  32.96 
 
 		 453 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  32.73 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 450 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  33.41 
 
 		 450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  33.51 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  33.51 
 
 		 459 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1313  Na+-driven multidrug efflux pump  29.93 
 
 		 449 aa  209  8e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0190769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1115  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000487521  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  34.23 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  34 
 
 		 453 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  32.45 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2139  MATE efflux family protein  33.79 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  30 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1023  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00302987  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>