More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0643 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  90.87 
 
 		 472 aa  788    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  100 
 
 		 477 aa  906    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  91.08 
 
 		 472 aa  793    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  43.05 
 
 		 471 aa  342  8e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  43.05 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  41.76 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  42.58 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  42.83 
 
 		 460 aa  315  9e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  44.07 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  43.12 
 
 		 472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  45.45 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  41.7 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  42.38 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  40.28 
 
 		 467 aa  293  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  41.27 
 
 		 474 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  40.5 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  41.77 
 
 		 451 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  41.65 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  41.52 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  39.45 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  39.42 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  37.19 
 
 		 458 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  39.96 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  37.5 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  40.09 
 
 		 470 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  35.32 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  39.5 
 
 		 460 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  36.89 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  36.71 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  40.6 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  37.06 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  36.3 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  36.3 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  36.3 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  35.15 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  36.09 
 
 		 462 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  35.87 
 
 		 462 aa  213  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  36.24 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  36.08 
 
 		 470 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  36.18 
 
 		 462 aa  210  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  37.78 
 
 		 464 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  36.42 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  37.67 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  37.67 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  37.67 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  37.67 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  34.58 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  37.67 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  37.44 
 
 		 468 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  37.67 
 
 		 468 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  35.05 
 
 		 488 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  34.45 
 
 		 462 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  33.26 
 
 		 460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  35 
 
 		 462 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  34.32 
 
 		 461 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  34.22 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  34.81 
 
 		 466 aa  193  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  32.97 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  34.77 
 
 		 462 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  28.8 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  32.6 
 
 		 462 aa  186  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.93 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  31.65 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  30.04 
 
 		 464 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 451 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  28.76 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  30.49 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  30.49 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  27.9 
 
 		 460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  27.33 
 
 		 457 aa  163  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  27.75 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  25.93 
 
 		 454 aa  160  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  26.27 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  26.49 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  26.27 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2408  MATE efflux family protein  37.73 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  26.65 
 
 		 452 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  28.67 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  26.55 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  26.49 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  26.02 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  28.44 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  26.77 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  28.44 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  28.44 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  28.44 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  25.88 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  26.55 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  26.33 
 
 		 452 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  27.78 
 
 		 457 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  27.78 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  27.78 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>