More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2408 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2408  MATE efflux family protein  100 
 
 		 433 aa  790    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  38.48 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  39.68 
 
 		 461 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  37.1 
 
 		 460 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  39.04 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  36.93 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  38.3 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  35.39 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  35.86 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  35.96 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  36.85 
 
 		 468 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  35.73 
 
 		 462 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  35.52 
 
 		 462 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  35.52 
 
 		 462 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  35.52 
 
 		 462 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  36.85 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  36.85 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  36.85 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  36.85 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  36.85 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  35.51 
 
 		 462 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  36.4 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  38.22 
 
 		 462 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  35.23 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  35.8 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  35.52 
 
 		 470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  38.07 
 
 		 462 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  35.52 
 
 		 462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  34.99 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  36.01 
 
 		 472 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  36.01 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  36.36 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  38.27 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  35.58 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  36.53 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  37.87 
 
 		 488 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  33.71 
 
 		 477 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  33.64 
 
 		 471 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  33.71 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  33.88 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  33.64 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  34.54 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  38.07 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  34.76 
 
 		 472 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  34.03 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  29.13 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  32.19 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  37.47 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  37.56 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  34.24 
 
 		 457 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  33.26 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  36.16 
 
 		 460 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  35.16 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  35.29 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  36.18 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  31.88 
 
 		 465 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  35.94 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  33.7 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  32.68 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  35.68 
 
 		 474 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  31.04 
 
 		 457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  38.29 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  31.58 
 
 		 464 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  37 
 
 		 470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  28.77 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  28.54 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  28.77 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  28.77 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  28.77 
 
 		 452 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  28.77 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  28.77 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  31.69 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  34.47 
 
 		 459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 456 aa  156  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  28.07 
 
 		 452 aa  156  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  30.92 
 
 		 453 aa  156  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  34.13 
 
 		 451 aa  155  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  31.46 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  28.54 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  31.46 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  31.46 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  31.33 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  31.33 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  33.26 
 
 		 490 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  33.26 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  31.33 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  31.33 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  31.24 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  30.44 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  33.56 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  31.11 
 
 		 457 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 480 aa  153  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  30.58 
 
 		 458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  29.73 
 
 		 455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>