More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1767 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  100 
 
 		 462 aa  929    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  54.17 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  52.07 
 
 		 457 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  36.64 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  36.2 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  35.56 
 
 		 454 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  34.96 
 
 		 466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  34.01 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  30.36 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  31.67 
 
 		 472 aa  217  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  30.63 
 
 		 461 aa  216  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 458 aa  214  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  32.67 
 
 		 466 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  30.55 
 
 		 456 aa  213  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 451 aa  212  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 474 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  31.21 
 
 		 456 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  31.4 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  30.07 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  30.04 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  30.04 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  32.65 
 
 		 456 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  33.69 
 
 		 457 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  32.61 
 
 		 477 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  32.61 
 
 		 477 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  30.53 
 
 		 470 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  29.36 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  30.2 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  29.67 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  30.24 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  29.66 
 
 		 465 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  32.37 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  28.32 
 
 		 454 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 458 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  31.38 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  28.51 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  31.07 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  28.51 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  28.51 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  28.51 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  29.2 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  29.19 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 460 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  31.15 
 
 		 451 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  28.98 
 
 		 457 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 462 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  28.73 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  29.01 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  30.85 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  27.35 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  30.85 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  30.11 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  30.11 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  30.85 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  30.85 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  30.85 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  30.11 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  30.43 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  28.17 
 
 		 453 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  30.44 
 
 		 460 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  30.11 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 462 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 462 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 462 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  30.11 
 
 		 457 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  30.85 
 
 		 468 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  29.6 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  28.73 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  28.54 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  30 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  30 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  29.81 
 
 		 457 aa  183  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  29.72 
 
 		 462 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  29.81 
 
 		 457 aa  183  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  30.69 
 
 		 472 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  28.51 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  29.59 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  31.49 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  30.29 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 457 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  29.59 
 
 		 457 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  29.78 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  29.78 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  27.92 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  29.33 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  29.5 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  29.33 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>