More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0033 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  100 
 
 		 463 aa  890    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  45.59 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  45.22 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  40.18 
 
 		 470 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  39.51 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  39.51 
 
 		 471 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  43.18 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  42.48 
 
 		 472 aa  318  9e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  43.17 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  43.21 
 
 		 468 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  42.26 
 
 		 490 aa  293  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  38.74 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  39.42 
 
 		 477 aa  279  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  40.4 
 
 		 472 aa  276  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  40.4 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  37.64 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  35.2 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  35.41 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  38.6 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  38.37 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  35.96 
 
 		 458 aa  243  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  36.62 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  36.14 
 
 		 467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  35.5 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  37.3 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  37.19 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  35.06 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  35.06 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  35.06 
 
 		 468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  35.06 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  35.06 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  35.06 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  35.51 
 
 		 462 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  35.51 
 
 		 462 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  35.51 
 
 		 462 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  35.06 
 
 		 468 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  35.59 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  35.73 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  34.69 
 
 		 462 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  34.21 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  35.15 
 
 		 460 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  34.75 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  34.49 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  34.73 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  35.15 
 
 		 462 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  35.15 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  36.59 
 
 		 463 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  34.68 
 
 		 462 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  34.37 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  34.67 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  34.76 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  34.37 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  34.83 
 
 		 462 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  35.48 
 
 		 488 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  35.43 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  33.41 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 462 aa  180  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  32.16 
 
 		 460 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.56 
 
 		 466 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  27.87 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  29.07 
 
 		 457 aa  172  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 457 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  31.99 
 
 		 451 aa  169  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  36.58 
 
 		 454 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  31.67 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  31.56 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  32.05 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  29.02 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  27.78 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 478 aa  163  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  33.7 
 
 		 486 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  31.11 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  28.89 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  31.11 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  25.6 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  25.38 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  25.38 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  25.6 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  27.45 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  31.74 
 
 		 466 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  24.28 
 
 		 454 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  29.95 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  30.2 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  29.05 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  29.05 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  29.05 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  29.05 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  29.33 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  29.33 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  29.05 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  29.05 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  29.33 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 453 aa  156  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  29.33 
 
 		 457 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>