More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1006 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1006  MATE efflux family protein  100 
 
 		 469 aa  871    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0948  MATE efflux family protein  95.44 
 
 		 464 aa  737    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1009  MATE efflux family protein  99.14 
 
 		 464 aa  855    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0988  MATE efflux family protein  68.57 
 
 		 470 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  36.34 
 
 		 486 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  30.92 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  32.74 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  35.26 
 
 		 467 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  30.95 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  30.13 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  31.33 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  31.33 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  30.74 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  31.33 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  34.3 
 
 		 456 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  31.09 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  34.41 
 
 		 477 aa  176  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  31.94 
 
 		 457 aa  176  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  30.26 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  30.26 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  30.77 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  35.74 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  30.77 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  34.54 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  30.67 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.73 
 
 		 466 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  30.04 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  30.04 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  30.04 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  31.75 
 
 		 460 aa  173  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  33.62 
 
 		 463 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  30.44 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  36.26 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  37.25 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  28.67 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  32.24 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  32.45 
 
 		 465 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  33.83 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  34.33 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  32.24 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  35.32 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  32.47 
 
 		 472 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  31.88 
 
 		 457 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  35.67 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  35.26 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  30.53 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  33.83 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  33.63 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  32.97 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  34.05 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  33.9 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  32.76 
 
 		 462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  35.14 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  28.29 
 
 		 472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  29.51 
 
 		 459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 460 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 459 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 459 aa  166  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  33.71 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  32.48 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  32.48 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  32.48 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  35.09 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  31.77 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  33.41 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  34.82 
 
 		 453 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  34.6 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  31.29 
 
 		 471 aa  163  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  31.29 
 
 		 471 aa  163  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  32.91 
 
 		 468 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  33.69 
 
 		 468 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  33.69 
 
 		 468 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  33.69 
 
 		 468 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  33.69 
 
 		 468 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  33.69 
 
 		 468 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  34.57 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  32.34 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  31.06 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  35.67 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  33.18 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>