More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04042 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  82.87 
 
 		 454 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  100 
 
 		 441 aa  853    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  73.91 
 
 		 453 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  73.91 
 
 		 453 aa  581  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  43.42 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  41.12 
 
 		 457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  42.01 
 
 		 477 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  42.01 
 
 		 477 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  42.03 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  37.56 
 
 		 457 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  37.56 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  37.56 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  34.72 
 
 		 458 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  35.8 
 
 		 458 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  35.86 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  34.87 
 
 		 459 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  34.64 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  35.42 
 
 		 453 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  37.56 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  38.29 
 
 		 475 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  34.87 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  35.71 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  35.4 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  34.64 
 
 		 459 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  35.17 
 
 		 459 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  34.64 
 
 		 459 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  35.17 
 
 		 459 aa  255  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  35.62 
 
 		 472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  34.64 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  36.41 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  36.18 
 
 		 458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  35.86 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  34.41 
 
 		 453 aa  252  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  35.1 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  36.41 
 
 		 456 aa  250  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  37.02 
 
 		 457 aa  249  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  37.53 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  36.95 
 
 		 457 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  34.32 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  37.53 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  37.53 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  37.53 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  33.95 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  36.95 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  36.95 
 
 		 457 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  36.95 
 
 		 457 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  36.95 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  36.95 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  36.95 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  36.95 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  36.95 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  32.87 
 
 		 460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  34.7 
 
 		 456 aa  243  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  35.76 
 
 		 457 aa  243  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  37.3 
 
 		 457 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  36.63 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  34.38 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  34.38 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  34.32 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  33.79 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  35.48 
 
 		 457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  33.79 
 
 		 470 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  35.33 
 
 		 454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  33.33 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  36.02 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  33.77 
 
 		 480 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  34.93 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 460 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  30.86 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  32.26 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  36.38 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  30.14 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  30.48 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  30.48 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  30.48 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3309  MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 479 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  30.37 
 
 		 455 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  30.25 
 
 		 454 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  35.29 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  29.68 
 
 		 453 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  35.52 
 
 		 462 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  34.93 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  34.93 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  34.93 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  34.93 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  34.93 
 
 		 468 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  34.93 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  35.52 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  36.16 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  30.75 
 
 		 454 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  36.12 
 
 		 470 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  34.7 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  34.38 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2429  multidrug efflux protein  33.87 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>