More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2021 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  100 
 
 		 459 aa  917    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  94.12 
 
 		 459 aa  855    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  94.55 
 
 		 459 aa  852    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  94.77 
 
 		 459 aa  857    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  77.4 
 
 		 452 aa  708    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  95.64 
 
 		 459 aa  863    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  77.95 
 
 		 458 aa  712    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  77.18 
 
 		 453 aa  670    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  95.21 
 
 		 459 aa  856    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  94.98 
 
 		 459 aa  855    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  95.21 
 
 		 459 aa  859    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  74.45 
 
 		 461 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  76.99 
 
 		 453 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  94.55 
 
 		 459 aa  855    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  79.28 
 
 		 453 aa  703    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  78.7 
 
 		 458 aa  720    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  51.35 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  52.49 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  52.02 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  52.02 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  52.02 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  52.13 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  49.89 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  51.79 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  50.22 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  51.79 
 
 		 457 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  50.99 
 
 		 458 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  51.79 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  51.79 
 
 		 457 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  50.33 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  51.79 
 
 		 457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  51.25 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  51.25 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  51.25 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  51.25 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  51.25 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  51.25 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  51.48 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  51.25 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  51.25 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  49.32 
 
 		 457 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  50.9 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  50.22 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  49.78 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  50 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  48.3 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  46.74 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  46.57 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  47.05 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  44.52 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  45.74 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  45.74 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  43.44 
 
 		 478 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  45.87 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  42.7 
 
 		 480 aa  351  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  42.17 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  41.9 
 
 		 475 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  40.68 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  39 
 
 		 455 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  40.32 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  36.81 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  39.86 
 
 		 455 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  36.44 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  40 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  36.22 
 
 		 453 aa  299  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  36.22 
 
 		 453 aa  299  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  36.22 
 
 		 453 aa  299  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  37.25 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  36.88 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  36.81 
 
 		 452 aa  292  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  36.44 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  36.59 
 
 		 452 aa  289  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  38.41 
 
 		 456 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  36.14 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  37.67 
 
 		 449 aa  280  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2429  multidrug efflux protein  37.41 
 
 		 455 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  34.15 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  37.04 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3309  MATE efflux family protein  36.83 
 
 		 479 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  34.32 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1313  Na+-driven multidrug efflux pump  32.58 
 
 		 449 aa  237  4e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0190769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3585  MATE efflux family protein  32.06 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  34.74 
 
 		 453 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  34.27 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  32.66 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1746  MATE efflux family protein  33.09 
 
 		 451 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325105  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2369  MATE family protein  31.51 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151607  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6244  MATE efflux family protein  32.5 
 
 		 450 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.813306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1835  MATE efflux family protein  32.5 
 
 		 450 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5136  multi anti extrusion protein MatE  32.21 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.944792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1279  putative inner membrane transmembrane protein  31.83 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0284384  normal  0.285043 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1859  MATE efflux family protein  32.5 
 
 		 450 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763838  normal  0.0423968 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1224  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 457 aa  199  9e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1773  MATE efflux family protein  33.09 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1438  MATE efflux family protein  32.72 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.805906  hitchhiker  0.00501053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1818  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 459 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.138431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1180  inner membrane transmembrane protein  32.27 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000781542  normal  0.19952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1115  MATE efflux family protein  31.73 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000487521  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0945  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>